Le flux « export » des marchandises au départ suit le cheminement suivant dans l’aérogare de fret :

• réception sur un quai "côté ville" ;
• enregistrement (pesage, remplissage de la LTA et facturation correspondante) ;
• stockage dans un magasin (sous douane si nécessaire),
• palettisation, c’est-à-dire regroupement par destination et par vol (palette ou container) ;
• pesage et stockage côté piste en attendant le chargement dans l’avion.

La phase de stockage n’existe pas si la préparation est continue c’est-à-dire si tous les colis sont immédiatement mis en conteneur ou sur palette, ce qui est courant pour les flux importants partant régulièrement pour une destination donnée.
Parfois, le fret est chargé "en vrac" dans des caisses de petites dimensions pouvant facilement s’adapter aux soutes de n’importe quel appareil.

Les marchandises subissent trois types de contrôles :

• un contrôle physique de sûreté : lorsqu’il doit être effectué dans l’aérogare de fret, celui-ci intervient avant la palettisation ;
• un contrôle douanier par sondage qui vise à vérifier empêcher les transports illégaux ;
• éventuellement un contrôle sanitaire pour certaines denrées périssables, végétaux ou animaux.

Le flux « import » suit le cheminement suivant :

• déchargement de l’avion ;
• introduction dans l’aérogare de fret ;
• dégroupage puis stockage avant la livraison ;
• contrôle physique éventuel des marchandises.

Pour le flux « transit » : si les unités de chargement (palettes/containers) ne nécessitent pas un "éclatement" intermédiaire, elles sont transférées directement du côté import au côté export. Si elles comprennent des colis pour diverses destinations, elles suivent les cheminements import et export décrits ci-dessus.